Репортаж от Wedoany，NVIDIA представила BioNeMo Agent Toolkit — набор профессиональных инструментов и открытых моделей, накопленных за более чем десять лет, для ИИ-агентов в области наук о жизни. Он позволяет агентам, учёным и лабораториям работать совместно, ускоряя научные открытия за счёт сбора доказательств, логических выводов на основе результатов, проведения вычислительных экспериментов и рекомендации оптимальных дальнейших шагов.
Этот набор объединяет библиотеки, инструменты и открытые модели в области наук о жизни, накопленные NVIDIA за более чем десять лет. Он предоставляет любому агенту или ИИ-платформе — включая универсальных ассистентов, специализированные научные агенты, программные платформы и внутренние биофармацевтические системы — инструменты, необходимые для синтеза и обобщения научных знаний, вызова моделей, оценки результатов, логических выводов и выполнения последующих действий. Набор включает NVIDIA BioNeMo и поддерживается технологиями NVIDIA NIM microservices, NVIDIA Parabricks, NVIDIA NeMo и NVIDIA Nemotron, а также ускоренными вычислениями и навыками, создавая открытую и надёжную основу для агентных наук о жизни.
Более 50 ведущих компаний уже используют этот набор для продвижения научных открытий, применяя вызываемые агентами навыки для таких задач, как предсказание структуры белков, молекулярный докинг, генеративная химия, геномный анализ, дизайн белков и поиск биомаркеров. Основатель и генеральный директор NVIDIA Дженсен Хуанг отметил, что передовые модели — это мозг, а BioNeMo — научный инструментарий; их сочетание наделяет ИИ-агентов навыками докторанта-исследователя и скоростью суперкомпьютера. Впервые исследователи могут создавать ИИ-агентов, которые понимают научные знания, используют научные инструменты и выполняют научные рабочие процессы. Это новый научный метод, способный значительно ускорить открытия в биологии, химии, геномике и медицине.
Открытые модели и исследовательские институты, включая Arc Institute, Open Molecular Software Foundation и Институт дизайна белков (Institute for Protein Design, IPD) Вашингтонского университета (University of Washington), сотрудничают с NVIDIA, используя BioNeMo для продвижения передовых моделей и делая их более доступными через готовые к использованию агентами рабочие процессы. Сотрудничество с IPD уже ускорило выполнение передовых моделей биодизайна, таких как RosettaFold3, производительность которых в 2 раза выше по сравнению с предыдущими моделями, и ведутся работы по дальнейшему ускорению дизайна белков. Дэвид Бейкер, профессор биохимии Медицинской школы Вашингтонского университета (University of Washington School of Medicine) и директор Института дизайна белков, отметил, что эффективность каждого создаваемого ими инструмента для дизайна белков зависит от того, насколько эффективно учёные могут его использовать. Следующий прорыв в науке произойдёт не из-за одного открытия, а из-за скорости итеративного дизайна и агентов, способных обдумывать сложность биологии с недоступной человеку скоростью.
Глобальные научно-исследовательские и опытно-конструкторские инвестиции в науки о жизни составляют 3,8 триллиона долларов США, а годовой фармацевтический бюджет приближается к 300 миллиардам долларов США. Агентные рабочие процессы могут помочь отрасли быстрее проводить итерации, одновременно снижая затраты и максимизируя вероятность успеха. С помощью этого набора разработчики могут за несколько минут превратить универсального агента в агента для наук о жизни, позволяя исследователям быстрее проводить эксперименты и постоянно учиться на результатах. Универсальные агенты могут испытывать трудности при эффективной навигации по научным рабочим процессам, требуя вывода правильных инструментов, входных и выходных данных, а также биологического значения. Данный набор помогает агентам вызывать правильные инструменты, точнее интерпретировать результаты и быстрее получать научные инсайты. NVIDIA оптимизирует всю платформу BioNeMo, превращая библиотеки, модели и фреймворки в вызываемые агентами инструменты, используя такие технологии, как открытые модели NVIDIA Nemotron, библиотека NVIDIA NeMo RL, план NVIDIA NemoClaw и среда выполнения NVIDIA OpenShell. Рабочие процессы, поддерживаемые компонентами набора, включают: виртуальный скрининг, помогающий исследователям идентифицировать кандидаты малых молекул путём генерации и фильтрации соединений, их докинга к мишеням, предсказания силы связывания и фильтрации лекарственно-подобных свойств, сокращая время скрининга с дней до минут; геномный анализ и поиск мишеней, помогающие ускорить выравнивание и обнаружение вариантов с помощью NVIDIA Parabricks, где геномные фундаментальные модели оценивают эффекты вариантов, а агенты ранжируют кандидаты по наиболее релевантным заболеваниям; дизайн белковых связывающих агентов, позволяющий вычислительно проектировать и проверять кандидаты, сжимая традиционные трудоёмкие дизайнерские работы; углублённые биомедицинские исследования, связывающие реальные данные с моделями рассуждений, включая обзор литературы, генерацию протоколов, скрининг клинических испытаний и фармаконадзор с помощью NVIDIA Biomedical AI-Q Research Agent; анализ медицинских изображений, помогающий обрабатывать, сегментировать, синтезировать и анализировать данные медицинских изображений для поддержки поиска биомаркеров.
Компании из технологической и научно-жизненной экосистем используют этот набор для продвижения агентных рабочих процессов. Передовые лаборатории и создатели научных агентов, включая Anthropic, Edison Scientific, Lila Sciences, OpenAI и Owkin, интегрируются с BioNeMo, чтобы помочь агентам перейти от ответов на вопросы к выполнению научных задач. Платформы научных данных и рабочих процессов от Benchling, Certara, Databricks, Snowflake и Seqera используют набор для соединения систем данных с наукой на основе ИИ; навыки помогают агентам запрашивать биологические и химические наборы данных, подготавливать входные данные, готовые для моделей, запускать воспроизводимые рабочие процессы, анализировать выходные данные и возвращать инсайты. Диагностические и фармацевтические компании, включая Lilly и Natera, используют набор для расширения воспроизводимых агентных рабочих процессов, охватывающих открытия, трансляционные исследования и клинические инсайты. AI-нативные биологические компании, включая Boltz, Basecamp Research, Chai Discovery, Dyno, PerturbAI и Proxima, сотрудничают с NVIDIA для разработки инструментов, ускоряющих управляемые моделями рабочие процессы дизайна терапий. Поставщики программного обеспечения для компьютерного поиска лекарств, включая Dassault Systèmes, Cadence (OpenEye) и Schrödinger, интегрируют функции набора, позволяя агентам координировать генерацию молекул, докинг и предсказания. Компании по производству лабораторного оборудования и автоматизации, включая Automata, HighRes, Tecan, Thermo Fisher, а также платформа автономной генерации данных Medra, подключают свои системы к вычислительным открытиям, поддерживаемым навыками BioNeMo. AI-облачные и AI-инфраструктурные компании, включая Baseten, Modal и Nebius, используют набор для поддержки навыков и инструментов BioNeMo через масштабируемые интерфейсы прикладного программирования, управляемые вычислительные среды и продукционные среды вывода, помогая превращать агентные биологические рабочие процессы из прототипов в сервисы.
BioNeMo Agent Toolkit и навыки теперь доступны через страницу ресурсов для разработчиков NVIDIA и GitHub.
Данный материал скомпилирован платформой Wedoany. При цитировании материалов, созданных с помощью искусственного интеллекта (ИИ), необходимо обязательно указывать источник — «Wedoany». В случае выявления нарушения прав или иных проблем просим своевременно информировать нас. Сайт оперативно внесёт изменения или удалит материал.Электронная почта: news@wedoany.com
