Репортаж от Wedoany，Компания Merck & Co. заключила многоцелевое соглашение о сотрудничестве и лицензировании в области открытия лекарств с компанией Protillion Biosciences, специализирующейся на искусственном интеллекте в дизайне лекарств. Цель соглашения — использовать метод «лаборатория в цикле» (lab-in-the-loop) и платформу Prot-MaP™ для открытия антител на чипе с целью выявления нескольких новых кандидатов на терапию. Согласно условиям соглашения, Merck выплатит Protillion нераскрытый авансовый платеж, а также поэтапные выплаты за исследования, разработку и коммерциализацию на сумму до 510 миллионов долларов.
Цель сотрудничества — объединить опыт Merck в области открытия новых методов лечения по всему миру с платформой Prot-MaP от Protillion. Prot-MaP расшифровывается как «Демонстрация белков на массиве с массовым параллелизмом» (Protein Display on a Massively Parallel Array). Эта платформа проводит количественный анализ белковых библиотек, используя непрерывный цикл обратной связи между ИИ и экспериментальными данными влажных лабораторий, характеризуя миллионы вариантов за один запуск, чтобы избежать переобучения модели. По данным Protillion, этот метод позволяет идентифицировать оптимизированные биопрепараты со сложными терапевтическими свойствами, такими как pH-зависимый клиренс и мультиспецифичность, которые трудно достичь традиционными методами. Платформа генерирует десятки миллионов иммобилизованных белковых кластеров непосредственно на проточной ячейке секвенатора Illumina с помощью эффективной лигированной in situ транскрипции и трансляции.
Prot-MaP была изобретена генеральным директором и сооснователем Protillion Кертисом Лейтоном (Curtis Layton) и сооснователем доктором Уиллом Гринлифом (Will Greenleaf), профессором генетики Медицинской школы Стэнфордского университета и членом научно-консультативного совета Protillion. Лейтон получил докторскую степень по вычислительной биологии в Университете Дьюка, после чего работал постдокторантом на кафедре генетики Медицинской школы Стэнфорда под руководством Гринлифа. Лейтон разработал Prot-MaP в лаборатории Гринлифа, а затем в 2019 году основал Protillion для коммерциализации этой технологии. Работа Лейтона открыла новый метод высокопроизводительного исследования биохимических систем, объединяющий белковую инженерию, технологии секвенирования следующего поколения, молекулярную биологию, транскрипцию и трансляцию in vitro, вычислительную биологию, разработку программного обеспечения и различные инженерные дисциплины.
Главный научный сотрудник Protillion доктор Роберт Холлингсворт (Robert Hollingsworth) сообщил изданию «Генная инженерия и биотехнологические новости» (GEN), что платформа Prot-MaP позволяет одновременно тестировать миллионы белковых взаимодействий, генерируя огромные объемы данных за несколько дней, а не месяцев. Платформа соединяет высокопроизводительное тестирование белков с проприетарными моделями машинного обучения, что позволяет быстро выявлять перспективные кандидаты на лекарства, понимать их механизмы действия и разрабатывать улучшенные версии. Prot-MaP способна одновременно тестировать до 1 миллиона белковых вариантов в одном эксперименте и выдавать результаты в течение 48 часов. Доктор Холлингсворт имеет более чем 30-летний опыт работы в биофармацевтике, ранее занимал должность главного научного сотрудника в Shoreline Therapeutics, а также работал в Pfizer (вице-президент и главный научный сотрудник по вакцинам против рака и иммунотерапии), Pharmacia & Upjohn (позже вошедшей в Pfizer), GlaxoSmithKline (GSK) и MedImmune (приобретенной AstraZeneca).
Protillion заявляет, что их стратегия отличается от большинства компаний: они не полагаются в основном на компьютерное прогнозирование белковых структур, а напрямую генерируют крупномасштабные функциональные данные и идентифицируют наилучшие терапевтические кандидаты на основе реальных экспериментальных результатов. Параллельно генерируя миллионы измерений белков, платформа создает наборы данных, необходимые для обучения более мощных моделей машинного обучения. По словам Лейтона, Protillion и Merck уже разработали план начала сотрудничества, причем первые два проекта будут сосредоточены на области воспалительных заболеваний. Лейтон отметил, что возможности платформы Prot-MaP не ограничиваются воспалением; она способна открывать и разрабатывать новые биопрепараты в широком спектре терапевтических областей и в будущем будет расширена на другие области заболеваний.
В последние месяцы Merck запустила несколько партнерств, ориентированных на технологии, чтобы дополнить свой портфель в области онкологии и иммунологии и смягчить последствия истечения патентной эксклюзивности на свои блокбастеры, включая Keytruda® и Gardasil® 9, в США и других регионах. В марте Merck подписала соглашение с Quotient Therapeutics на сумму до 2,2 миллиарда долларов для применения их платформы соматической геномики для поиска новых мишеней для лекарств от воспалительных заболеваний кишечника (ВЗК). В том же месяце Merck также начала сотрудничество с Infinimmune для разработки кандидатов на антитела с использованием их платформы открытия Anthrobody® и языковой модели антител GLIMPSE™, с максимальными поэтапными выплатами в 838 миллионов долларов. Кроме того, Merck запустила партнерства с Google Cloud, Tempus AI и клиникой Мэйо.
Вице-президент по открытию биологии в Исследовательских лабораториях Merck доктор Хуан Альварес (Juan Alvarez) заявил в пресс-релизе, что платформа Protillion предоставляет убедительную возможность, и он с нетерпением ждет сотрудничества с командой для продвижения этих проектов. Protillion, штаб-квартира которой находится в Карлсбаде, Калифорния, в настоящее время насчитывает 30 сотрудников. Компания заявляет, что продолжает расширять команду и мощности для поддержки внутреннего портфеля и высокоценных стратегических партнерств. Венчурное подразделение Illumina, Illumina Ventures, является одним из инвесторов Protillion и в 2022 году совместно с ARCH Venture Partners возглавило раунд финансирования в размере 18 миллионов долларов. Лейтон сообщил, что планирует нанять еще 6 штатных сотрудников до конца года.
Данный материал скомпилирован платформой Wedoany. При цитировании материалов, созданных с помощью искусственного интеллекта (ИИ), необходимо обязательно указывать источник — «Wedoany». В случае выявления нарушения прав или иных проблем просим своевременно информировать нас. Сайт оперативно внесёт изменения или удалит материал.Электронная почта: news@wedoany.com
